腸病毒典型常見症狀：手口足病 ─
發燒或微燒，手掌、腳掌、屁股 和膝蓋等部位零散不痛、不癢、不結痂、不結疤的小而呈長橢圓型淡紅斑疹或小水泡疹；口腔黏膜及舌頭，其次為軟顎、牙齦和嘴唇出現水泡潰瘍，而疼痛、厭食、流口水(小小孩)。
疱疹性咽峽炎 ─ 突發性發燒、嘔吐及咽峽處(只有口腔後半部)出現小水泡、或潰瘍；厭食、流口水。
嬰幼兒有些第一天只有發高燒輕微嘔吐，咽峽部可能是正常或有點紅暈水泡而已，到第2、3天才有明顯小水泡或潰瘍。因此有些家長不瞭解為什麼第一天看診的醫生沒看出來，其實在流行期，發燒幼童都應注意口腔變化的可能性。
因此醫生有時會請有懷疑腸病毒感染的小朋友次日回診檢查確定，或發燒小朋友回家抱怨喉嚨很痛、厭食流口水，可再請醫生看看喉嚨並檢查四肢、膝蓋及屁股。
疱疹性咽峽炎常被誤以為是長牙
嬰兒發燒、厭奶、流口水增加，也應請醫生檢查寶寶的咽峽部，有無小水泡或潰瘍，因為疱疹性咽峽炎常被阿媽誤以為是長牙沒關係。
鑑別診斷疱疹齒齦舌炎
疱疹性咽峽炎，在口腔「後半部」咽峽位置出現小水泡或潰瘍，因類似疱疹表現，直譯為疱疹性，但有的專家建議直接叫咽峽炎而不要加上疱疹性，因為當年翻譯時不知是腸病毒引起，一般人又容易與疱疹混淆，尤其兩者在初期症狀都很類似。如果牙齦紅腫，舌頭潰爛，口腔前部黏膜也有破洞，四肢無水泡，則是疱疹病毒引起的疱疹齒齦舌炎，不是腸病毒，但可能會張口就流血，即早給予ZOVIRAX可有效防治疱疹齒齦舌炎變嚴重(健保一般是不會給付的)，腸病毒引起的咽峽炎則無效。
觀察有無重症前驅症狀的變化
如果小孩子的活動力不錯、精神狀況很好，就可較放心觀察。但嚴重併發症大多以猝發型式突然出現，仍應小心，尤其是3歲以下的小朋友在皮膚上 (手掌、腳掌、口腔黏膜、屁股和膝蓋) 出現疹子的5天內。
有下列情況需立刻就醫，儘速請醫師診查是否有少見的腦膜腦炎及心肌炎等。
(1) 有嗜睡、意識不清、活力不佳、手腳無力應即早就醫，一般神經併發症是在發疹二至四天後出現。(2) 肌抽躍（類似受到驚嚇的突發性全身肌肉收縮動作）。(3) 持續嘔吐。(4) 持續發燒、活動力降低、煩躁不安、意識變化、昏迷、頸部僵硬、肢體麻痺、抽搐、呼吸急促、全身無力、心跳加 快或心律不整等。
症 狀 嗜睡或無法入眠 除了一直想睡外，病童也顯得疲倦無力，原來活潑得小孩會變的安靜不想動。 無故驚嚇或突然間全身肌肉收縮 通常是在睡眠中時出現突然被驚嚇或嚇哭之現象，或與前一項同時發生突然全身肌肉收縮，隨著病情變化嚴重時，在清醒時也會出現。 食慾不振或持續嘔吐 食慾不振超過24小時，一天嘔吐之次數超過兩次以上，尤其是沒吃東西時也吐，要特別注意。 呼吸急促或心跳加快 在休息狀態下，呼吸急促或心跳超過每分鐘100次以上
腸病毒重症臨床分期
第一期：手足口病
症狀治療為主，如退燒、止痛、預防與治療脫水。
腸病毒71型，大部份都會有手足口病，手腳會有疹子，如果病患為五歲以下幼童(高危險群)，應該要提高醒覺有無重症前驅症狀。
第二期 : 腦膜腦炎
第三A期 : 高血壓一肺水腫出血-自主神經失調
第三B期 : 低血壓；心臟衰竭
第四期 : 逐漸恢復，神經可能有嚴重後遺症
標準的症狀是口腔的後部、手「掌」、腳「掌」出現水泡、潰爛，在膝蓋與臀部也時常看得到相同的水泡所以常稱了為「手足口症」。
如果只有口腔「後半部」出現水泡，其它地方沒有，則稱之為「咽峽炎」。
最明顯的症狀是喉嚨很疼，不敢吃東西，口水變多，同時也可能有高燒，平均七天會痊癒。有的小朋友也可能不出現標準的手足口症或咽峽炎，只有一般的感冒發燒症狀，但是在發燒退了以後，皮膚會出現類似長痱子一樣，以軀幹為主的全身性紅疹，醫學上稱之為「熱性疹症(febrile exanthematous disease)」。
如果合併有「昏睡」、「抽筋」、「嘔吐」等症狀則要住院處理而且可能有危險性，因為可以合併出現無菌性腦炎、肺炎、心肌炎、心包膜炎及麻痺等併發症。其它的危險因子還包括有：發高燒超過三天，血糖超過15Omg/dl，以及出現四肢無力的症狀等，都要特別注意。
腸病毒所引起的咽峽炎與另一種病「皰疹性齒齦舌炎(Herpetic Gingivostomatitis)」甚為相似，但是「皰疹性齒齦舌炎」的潰爛位置是在口腔「前半部」，一樣會疼痛、流口水，但是不是腸病毒造成的。
，通常建議停課三週。
第二是糞口傳染：腸病毒生存力、繁殖力強，經腸胃道排出長達2個月。 第三是接觸傳染：污染的手接觸摸眼、口、鼻而受到感染。
腸病毒「三危」
第一危：危險族群，3歲以下。根據1998年，腸病毒疫情統計，78%的死亡案例年齡小於3歲。第二危：危險期間，3天之內。腸病毒71型引起重症和死亡的病例，其發病到就診時間，平均3.4天，許多病例在第三天之後才到急 診或加護病房，以致搶救不及。所以發病的最初三天，病情變化極不穩定，最需要密切追蹤。第三危：危險症狀有三，昏睡、持續嘔吐和肌躍型抽搐。針對腸病毒71型所引發的腦幹腦炎致死及瀕死病例分析，發現這三種臨 床症狀最有指標價值，若有上述症狀，必須以重症處理。
腸病毒有三不怕
●不怕室溫：可以在室溫活好幾天。 ●不怕胃酸：可在腸胃繁殖。 ●不怕酒精、乙醛等消毒物品。
如出現持續或反覆高燒、嘔吐、嗜睡、不安．意識不清．活力不佳．咳嗽、呼吸急促等非典型症狀，或有任何疑義，請儘速就醫
。有關免疫球蛋白之使用，因其效果尚在試驗階段，同時必須考慮其可能之潛在危險，故應由醫師審慎評估。
一般而言，腸病毒發病後七天內是重症發生的危險期，照顧上應以多喝水、多休息為原則，以免造成脫水、休克或其他併發症的產生。
所謂「知己知彼，百戰百勝」，要預防腸病毒的感染就要了解腸病毒的特性、傳播途逕以及其致病機轉。
由於腸病毒型別很多，無法得過一次就終身免疫，而且目前並沒有疫苗可以預防（小兒麻痺除外），又因其可經口、飛沫及接觸等途徑傳染，控制不易，故大家應注意下列預防方法：
一、高危險群：三歲以下小孩要特別小心，有較高比率得到腦炎、類小兒麻痺症候群或肺水腫。
二、增強個人之免疫力：注意營養、均衡飲食、適當運動及充足睡眠。三、加強個人衛生：正確且勤加洗手，以預防自身感染，及避免藉由接觸傳染給嬰幼兒。四、注意環境衛生：保持環境清潔及通風。五、避免接觸受感染者：避免出入過度擁擠之公共場所，避免與病患接觸。六、如有疑似腸病毒感染症狀請儘速就醫。七、家中有病患時應注意：（一）小心處理病患之排泄物（糞便、口鼻分泌物），且處理完畢應立即洗手。（二）多補充水分，學童儘量請假在家休息，以避免傳染給同學。（三）對群體中之第二個病患要特別小心，其所接受的病毒量往往較高，嚴重程度可能提高。（四）有下列情況需立刻就醫：1.有嗜睡、意識不清、活力不佳、手腳無力應即早就醫，一般神經併發症是在發疹二至四天後出現。2.肌抽躍（類似受到驚嚇的突發性全身肌肉收縮動作）。3.持續嘔吐。4.持續發燒、活動力降低、煩躁不安、意識變化、昏迷、頸部僵硬、肢體麻痺、抽搐、呼吸急促、全身無力、心跳加快或心律不整等。5.患者應避免與孕婦、新生兒及小孩接觸。
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